La qualité des milieux aquatiques est étudiée à partir de plusieurs paramètres et notamment les indices biologiques. Cela correspond à l’inventaire de quelques groupes de la flore et la faune des cours d’eau pour évaluer la qualité du milieu. Les peuplements de poissons constituent un des indicateurs utilisé pour l’évaluation
La pêche électrique est le procédé utilisé pour les inventaires piscicoles en rivière. Elle consiste à immobiliser le poisson pendant quelques secondes à l’aide d’un courant électriques dans le cours d’eau, le temps de le capturer avec une épuisette. Les individus sont ensuite identifiés, mesurés, pesés puis remis à l’eau en fin d’intervention. Ce protocole permet d’avoir une connaissance très détaillée du peuplement piscicole en place et est inoffensif pour les poissons.
Le réseau de suivi piscicole est supervisé par l’AFB (Agence Française de la Biodiversité). Les pêches sont réalisées par leurs services ou déléguées à des bureaux d’études. Plusieurs pêches ont eu lieu sur le territoire en 2019, il s’agit entre autre de la Vonne à Ménigoute et à Jazeneuil, de la Bouleure à Vaux-en-Couhé ainsi que du Clain à Anché.
Les données recueillies sont publiques et disponibles (année n-1) sur le site http://www.naiades.eaufrance.fr/ (rubrique « accès aux données puis « hydrobiologie »). Une application mobile est également disponible, elle s’intitule « Qualité rivière » et permet de visualiser à partir d’une cartographie les stations de suivi et les résultats